Que não apresenta ou não constitui sintoma. Um indivíduo assintomático está infectado, mas não apresenta os sintomas de uma determinada doença.

Do inglês Amplicon Sequence Variant, ASV é uma das abordagens utilizadas para analises de microbioma. Diferente de OTU, esta técnica busca encontrar sequências únicas e exatas de um determinado organismo, possibilitando analises da composição, abundância e diversidade microbiana de um determinado ambiente.

Organismo procarioto e unicelular, encontradas em diversos ambientes e em vários formatos como: esferas, hastes e espirais.  Muitas destas bactérias convivem em harmonia e são benéficas para o corpo humano, outras podem ser patogênicas e prejudiciais a saúde. Estima-se que no corpo humano há 1,3x células bacterianas para cada célula humana.

Bioinformática é uma área interdisciplinar que se dedica ao estudo, investigação e análise de dados biológicos gerados pelas mais variadas técnicas e fontes. É comum considerar que as principais áreas componentes da bioinformática sejam as ciências biológicas, ciências da computação e estatística, porém outras áreas e cursos também são importantes, como a física, ciências biomédicas, etc. A análise de dados NGS é uma das sub-áreas mais ativas dentro da bioinformática, sendo responsável pelo desenvolvimento de algoritmos de análises diversos e as próprias análises em si. Outro ponto interessante a considerar é que a bioinformática está muito relacionada com á área de ciência dos dados, sendo o bioinformata um cientista dos dados especializado em dados biológicos.

Referente a família de vírus Coronaviridae. Coronavirus é um grupo de vírus que ganhou esse nome pelo formato semelhante a uma coroa. Dentro desse grupo encontramos vírus como o Mer-Cov, Sars-Cov e o SARS-CoV-2 responsável pela doença COVID-19.

A COVID-19 é uma doença causada pelo coronavírus, denominado SARS-CoV-2, que apresenta um espectro clínico variando de infecções assintomáticas a quadros graves, podendo levar a óbito. Em 11 de março de 2020, foi declara a pandemia de COVID-19 pela Organização Mundial da Saúde (OMS).

Ácido desoxirribonucléico, ou simplesmente DNA, é a molécula que contém toda a informação genética de um organismo. É através desta molécula que as características de um organismo são passadas de geração para geração. Em termos mais técnicos, a molécula de DNA é composta de um arcabouço de fosfato, um grupo açúcar (desoxiribose) e uma base nitrogenada (podendo ser Adenina, Guanina, Citosina e Timina). O encadeamento sequencial de diferentes bases nitrogenadas ao longo da molécula (A, C, T, G…) determinam a sequencia dos genes e, consequentemente, as características dos organismos.

É a manifestação coletiva de uma doença que rapidamente se espalha, por contágio direto ou indireto, até atingir um grande número de pessoas em um determinado território. Ver também: surto e pandemia.

São as características observadas de um organismo ou população, como por exemplo: morfologia, cor dos olhos, propriedades bioquímicas. O fenótipo resulta do genótipo e da influência de fatores ambientais e epigenéticos.

Pode ser definido como o conjunto completo de genes, junto com fatores ambientais e epigenéticos, determinam o fenótipo de um organismo.

Metagenômica é uma área de estudo da bioinformática e biologia molecular dedicada ao estudo do conjunto de microrganismos em amostras ambientais e clínicas, tais como amostras de solo, água, sangue e fezes. Trata-se de uma área recente de estudo, que tornou-se possível graças à evolução vertiginosa das tecnologias de sequenciamento massivo paralelo conhecidas genericamente como NGS (Next Generation Sequencing). Graças à evolução das técnicas de NGS, hoje é possível que os pesquisadores realizem o sequenciamento de centenas a milhares de genomas de microrganismos contidos numa amostra de uma única vezes, fazendo contraste às técnicas de genômica iniciais onde era comum o sequenciamento de um genoma por vez apenas. A metagenômica é a ciência base por trás de exames clínicos que vêm revolucionando o diagnóstico de agentes infecciosos conhecidos e muitas vezes até desconhecidos.

Microbioma é a coleção de genomas de todos os microrganismos encontrados em um determinado ambiente. Humanos, plantas e outros animais possuem microbiomas associados, esses microbiomas são individuais para cada organismo; a diversidade de microbiomas entre os indivíduos é enorme e, mesmo dentro de uma pessoa, pode haver ampla variação em sua composição microbiana, da pele aos pulmões, todos esses microbiomas específicos constituem um microbioma exclusivo para cada ser humano.

A microbiota é a grande variedade de microrganismos que vive em um determinado ambiente.

Alteração, natural ou induzida, que ocorre no material genético de um organismo. Essas alterações podem ou não alterar o fenótipo dos organismos.

NGS, ou sequenciamento de nova geração, faz referência a um conjunto de técnicas de sequenciamento de alta performance e rendimento. As técnicas de NGS fazem contraste ao método de sequenciamento por Sanger, que é uma técnica limitada e de baixo rendimento. Numa única corrida de sequenciamento NGS pode-se gerar leituras de bilhões de pares de base. São exemplos de plataforma de sequenciamento NGS, os equipamentos da fabricante Illumina, ThermoFisher e Roche. O NGS é muito utilizado atualmente na área clínica para o diagnóstico de doenças raras, na oncologia, na farmacogenética, no diagnóstico de doenças infecciosas e muitas outras áreas.

Número de casos de uma determinada doença acima do esperado, afetando vários países e continentes. Ver também: surto e epidemia.

A reação em cadeia de polimerase, ou PCR da sigla em inglês, é uma das principais e mais importante técnica de biologia molecular. Seu objetivo é a amplificação de um fragmento específico do material genético (DNA) de forma repetitiva e exponencial para gerar muitas cópias da molécula. Os componentes principais de uma reação de PCR são: 1. DNA template alvo a ser amplificado; 2. Primers que encontram a região alvo de forma específica para iniciar a amplificação; 3. Nucleotídeos (A,C,T,G); 4. Enzima DNA polimerase que adiciona nucleotídeos à nova molécula seguindo o template da molécula alvo em (1).  Este é o princípio de muitas técnicas de biologia molecular e exames para diagnóstico clínico, como é o caso do RT-PCR para diagnóstico de COVID-19.

Primers, ou iniciadores, são pequenos oligonucleotídeos utilizados para iniciar a reação de PCR. Em outras palavras, primers são pequenas sequências de 15 nt a 24nt sintetizados artificialmente para hibridizar com regiões específicas de um genoma alvo. Todo ensaio de PCR necessita um par de primers, denominados forward e reverse. Eles delimitam o fragmento que será amplificado, que geralmente tem entre 100 nt e 2000 nt.

Ácido ribonucleico, ou simplesmente RNA é uma molécula polimérica essencial em vários papéis biológicos. Como o DNA, o RNA é montado como uma cadeia de nucleotídeos, mas ao contrário do DNA, o RNA é encontrado na natureza como uma fita simples dobrada sobre si mesma, em vez de uma fita dupla emparelhada e no lugar da Timina, encontrada no DNA, no RNA encontramos a Uracila (U). Muitos vírus codificam sua informação genética usando um genoma de RNA.

Um ensaio experimental para amplificar determinados trechos de DNA similar ao ensaio de PCR (ver verbete PCR). A diferença se encontra numa etapa inicial adicional do ensaio, onde o RNA total de uma amostra é reverso transcrito para DNA complementar (cDNA) com o uso de oligonucleotídeos randômicos. O cDNA pode então, ser amplificado especificamente de acordo com os primers utilizados. O principal exame para diagnóstico de COVID-19 é baseado neste princípio.

RT-PCR também pode referir-se a Real-Time PCR ou quantitative PCR (qPCR), que é uma técnica controlada onde a amplificação de um alvo pela reação de PCR é monitorada em tempo real para quantificação da amplificação e, consequentemente, da quantidade inicial de moléculas do alvo.

Nome oficial dado ao novo coronavírus, responsável pela pandemia de COVID-19. SARS-CoV-2, vem do inglês “severe acute respiratory syndrome coronavirus 2” (síndrome respiratória aguda grave de coronavírus 2). Ele recebeu essa nomenclatura por possuir grande semelhança com o vírus SARS-CoV, agente causador da epidemia de SARS, em 2002.

Spike é o nome de uma proteína do SARS-CoV-2, ela desempenha um papel fundamental na adesão a célula do hospedeiro.  Através dela, o vírus se liga ao receptor ACE2 das células humanas para iniciar a infecção.

Aumento repentino do número de casos, dentro de um limite restrito ou de uma doença específica. Ver também: epidemia e pandemia.

Os testes sorológicos são indicados para serem feitos a partir da segunda semana pós infecção. Os testes sorológicos são realizados a partir de amostra de soro após punção venosa e tem como objetivo a detecção de anticorpos contra o vírus. O teste detecta anticorpos do tipo IgG e IgM, produzidos pelo indivíduo após o contato com o vírus.

Viroma consiste no estudo detalhado e abrangente da porção viral de amostras ambientais por técnicas de sequenciamento de nova geração (NGS) e bioinformática. Trata-se de uma sub-técnica da metagenômica (ver verbete correspondente), onde o RNA ou DNA viral total de uma amostra é sequenciado para gerar informações de diversidade e abundância viral. Na área clínica, está técnica é uma alternativa não enviesada ao PCR para diagnóstico de agentes infecciosos virais, como o SARS-CoV-2, DENGUE, ZIKA, e muitos outros vírus.

Vírus não são considerados seres vivos, uma vez que eles não possuem uma estrutura de célula. Os vírus são parasitas intracelulares obrigatórios, isso significa que são completamente dependentes de outras células para se replicar. A estrutura básica é composta por dois componentes: algum tipo de ácido nucléico (DNA ou RNA) e um envoltório feito de proteínas, chamado de capsídeo.